https://dude.cryomint.com/tags/cell/ Recent content in Cell on 都德的博客 Hugo -- 0.146.0 zh-cn Sat, 14 Feb 2026 02:36:00 +0800 https://dude.cryomint.com/posts/2026-02-14-pangenome-cns-summary/ Sat, 14 Feb 2026 02:36:00 +0800 https://dude.cryomint.com/posts/2026-02-14-pangenome-cns-summary/ <h2 id="1-nature-2025-leveraging-a-phased-pangenome-for-haplotype-design-of-hybrid-potato">1. Nature (2025): Leveraging a phased pangenome for haplotype design of hybrid potato</h2> <ul> <li><strong>内容</strong>：构建了 31 个二倍体马铃薯（含 10 个野生种、19 个栽培种、2 个自交系）的 60 个单倍型的 phased pangenome graph</li> <li><strong>亮点</strong>： <ul> <li>用 PGGB 和 Minigraph-Cactus 构建了马铃薯图泛基因组</li> <li>系统揭示了 SV 在进化和驯化中的起源与命运</li> <li>设计了“理想马铃薯单倍型 (IPHs)”用于杂交育种</li> </ul> </li> <li><strong>意义</strong>：为无性繁殖作物的基因组设计育种奠定理论基础</li> </ul> <h2 id="2-nature-2025-a-pangenome-reference-of-wild-and-cultivated-rice">2. Nature (2025): A pangenome reference of wild and cultivated rice</h2> <ul> <li><strong>内容</strong>：构建了 145 个染色体水平的水稻泛基因组（16 个栽培稻 + 129 个野生稻 O. rufipogon）</li> <li><strong>亮点</strong>： <ul> <li>支持“单次驯化起源”假说：所有亚洲栽培稻均源自 Or-IIIa（粳稻祖先）</li> <li>精细解析了栽培稻与野生稻之间的基因流</li> <li>挖掘了大量抗病/抗逆基因资源</li> </ul> </li> <li><strong>意义</strong>：为水稻育种提供全面的野生种质遗传变异资源</li> </ul> <h2 id="3-nature-genetics-2025-super-pangenome-of-vitis-empowers-identification-of-downy-mildew-resistance-genes-for-grapevine-improvement">3. Nature Genetics (2025): Super pangenome of Vitis empowers identification of downy mildew resistance genes for grapevine improvement</h2> <ul> <li><strong>内容</strong>：构建了葡萄属（Vitis）的超级泛基因组</li> <li><strong>亮点</strong>： <ul> <li>覆盖整个葡萄属的综合基因组信息</li> <li>成功挖掘了霜霉病（downy mildew）抗性基因</li> </ul> </li> <li><strong>意义</strong>：为葡萄抗病育种提供直接靶点</li> </ul> <h2 id="4-nature-2025-pan-genome-bridges-wheat-structural-variations-with-habitat-and-breeding">4. Nature (2025): Pan-genome bridges wheat structural variations with habitat and breeding</h2> <ul> <li><strong>内容</strong>：小麦泛基因组与 SV、生境、育种的关联研究</li> <li><strong>亮点</strong>： <ul> <li>揭示了小麦结构变异与生境适应及育种性状的关联</li> <li>以 VRN-A1 基因为例展示了转录水平在冬性品种中的变化</li> </ul> </li> <li><strong>引用</strong>：已被引 110 次，是近期小麦泛基因组领域的高影响力工作</li> </ul> <h2 id="5-其他重要论文">5. 其他重要论文</h2> <ul> <li><strong>Nature (2025)</strong>: The phased pan-genome of tetraploid European potato（四倍体欧洲马铃薯 phased 泛基因组）</li> <li><strong>Nature Plants (2025)</strong>: Pan-genome analysis provides insights into legume evolution and breeding（豆科泛基因组与进化育种）</li> <li><strong>Nature Genetics (2025)</strong>: Pan-genome analysis reveals the evolution and diversity of Malus（苹果属泛基因组进化与多样性）</li> <li><strong>Trends Microbiol (Cell, 2025)</strong>: On the biological meaning of the population pangenome（群体泛基因组的生物学意义综述）</li> <li><strong>Nature Reviews (2025)</strong>: The role of pangenomics in orphan crop improvement（泛基因组在孤儿作物改良中的作用综述）</li> </ul> <hr> <p><strong>总体趋势</strong>：2024-2026 年 pangenome 领域的主流是 <strong>phased 图泛基因组 + 从种质资源到育种应用的闭环</strong>，重点作物包括马铃薯、水稻、小麦、葡萄、苹果、豆科等，核心方向是挖掘 SV、单倍型设计、野生种质利用。</p>