https://dude.cryomint.com/ja/tags/cell/ Recent content in Cell on 都德のブログ Hugo -- 0.146.0 ja Sat, 14 Feb 2026 02:36:00 +0800 https://dude.cryomint.com/ja/posts/2026-02-14-pangenome-cns-summary/ Sat, 14 Feb 2026 02:36:00 +0800 https://dude.cryomint.com/ja/posts/2026-02-14-pangenome-cns-summary/ <h2 id="1-nature-2025-leveraging-a-phased-pangenome-for-haplotype-design-of-hybrid-potato">1. Nature (2025): Leveraging a phased pangenome for haplotype design of hybrid potato</h2> <ul> <li><strong>内容</strong>: 31個の二倍体ジャガイモ（野生種10個、栽培種19個、自殖系2個）の60個のハプロタイプからなるフェーズドパンゲノムグラフを構築</li> <li><strong>ハイライト</strong>: <ul> <li>PGGBとMinigraph-Cactusを用いてジャガイモのグラフパンゲノムを構築</li> <li>SVの進化と驯化における起源と運命を系統的に解明</li> <li>雑種育種のための「理想的なジャガイモハプロタイプ（IPHs）」を設計</li> </ul> </li> <li><strong>意義</strong>: 無性繁殖作物のゲノム設計育種の理論的基礎を築いた</li> </ul> <h2 id="2-nature-2025-a-pangenome-reference-of-wild-and-cultivated-rice">2. Nature (2025): A pangenome reference of wild and cultivated rice</h2> <ul> <li><strong>内容</strong>: 145個の染色体レベルのイネパンゲノム（栽培イネ16個 + 野生イネO. rufipogon 129個）を構築</li> <li><strong>ハイライト</strong>: <ul> <li>「単回驯化起源」仮説を支持：すべてのアジア栽培イネはOr-IIIa（ジャポニカの祖先）に由来</li> <li>栽培イネと野生イネの間の遺伝子流動を精緻に解析</li> <li>多数の耐病・耐ストレス遺伝子資源を発掘</li> </ul> </li> <li><strong>意義</strong>: イネ育種に包括的な野生種質の遺伝的変異資源を提供</li> </ul> <h2 id="3-nature-genetics-2025-super-pangenome-of-vitis-empowers-identification-of-downy-mildew-resistance-genes-for-grapevine-improvement">3. Nature Genetics (2025): Super pangenome of Vitis empowers identification of downy mildew resistance genes for grapevine improvement</h2> <ul> <li><strong>内容</strong>: ブドウ属（Vitis）のスーパーパンゲノムを構築</li> <li><strong>ハイライト</strong>: <ul> <li>ブドウ属全体をカバーする包括的なゲノム情報</li> <li>べと病（downy mildew）耐性遺伝子の発掘に成功</li> </ul> </li> <li><strong>意義</strong>: ブドウの耐病育種に直接的なターゲットを提供</li> </ul> <h2 id="4-nature-2025-pan-genome-bridges-wheat-structural-variations-with-habitat-and-breeding">4. Nature (2025): Pan-genome bridges wheat structural variations with habitat and breeding</h2> <ul> <li><strong>内容</strong>: コムギパンゲノムとSV、生息環境、育種の関連研究</li> <li><strong>ハイライト</strong>: <ul> <li>コムギの構造変異と生息環境適応および育種形質の関連を解明</li> <li>VRN-A1遺伝子を例に、冬性品種における転写レベルの変化を示した</li> </ul> </li> <li><strong>引用</strong>: 被引用数110回、近年のコムギパンゲノム分野で影響力の高い研究</li> </ul> <h2 id="5-その他の重要な論文">5. その他の重要な論文</h2> <ul> <li><strong>Nature (2025)</strong>: The phased pan-genome of tetraploid European potato（四倍体ヨーロッパジャガイモのフェーズドパンゲノム）</li> <li><strong>Nature Plants (2025)</strong>: Pan-genome analysis provides insights into legume evolution and breeding（マメ科パンゲノムと進化育種）</li> <li><strong>Nature Genetics (2025)</strong>: Pan-genome analysis reveals the evolution and diversity of Malus（リンゴ属パンゲノムの進化と多様性）</li> <li><strong>Trends Microbiol (Cell, 2025)</strong>: On the biological meaning of the population pangenome（集団パンゲノムの生物学的意義に関する総説）</li> <li><strong>Nature Reviews (2025)</strong>: The role of pangenomics in orphan crop improvement（マイナー作物の改良におけるパンゲノミクスの役割に関する総説）</li> </ul> <hr> <p><strong>全体的なトレンド</strong>: 2024-2026年のパンゲノム分野の主流は <strong>フェーズドグラフパンゲノム + 種質資源から育種応用までのクローズドループ</strong> で、重点作物はジャガイモ、イネ、コムギ、ブドウ、リンゴ、マメ科など、コアな方向性はSVの発掘、ハプロタイプ設計、野生種質の利用である。</p>